ओलिंक -लोगो

ओलिंक नोव्हासेक ६००० एस४ एक्सप्लोर एचटी सिक्वेन्सिंग सिस्टम

Olink-NovaSeq-6000-S4-एक्सप्लोर-HT-सिक्वेन्सिंग-सिस्टम-उत्पादन

तपशील

  • मॉडेल: 1351
  • आवृत्ती: v1.1
  • तारीख: 2023-12-12

भाग २: ओव्हरview

परिचय
हे उत्पादन प्रयोगशाळेच्या वापरासाठी डिझाइन केलेले आहे आणि धावांचे अनुक्रमांकन करण्यासाठी तपशीलवार सूचनांसह येते.

 अभिप्रेत वापर
या उत्पादनाचा उद्देश प्रयोगशाळांमध्ये क्रमवारी लावणे सुलभ करणे आहे.

या मॅन्युअल बद्दल
उत्पादन वापरादरम्यान सतर्कतेची पातळी आणि सुरक्षितता सूचनांबद्दल महत्त्वाची माहिती या मॅन्युअलमध्ये दिली आहे.

भाग २: प्रयोगशाळेतील सूचना

परिचय

  • कस्टम रेसिपी फोल्डर अनझिप करा आणि ओलिंक कस्टम रेसिपी सेव्ह करा.
  • XML file योग्य फोल्डरमध्ये.

अनुक्रमांकन धावण्याची योजना करा

  • NovaSeqTM 6000 S4 Reagent Kit v1.5 सह सुसंगतता सुनिश्चित करा आणि
  • नोव्हासेक कंट्रोल सॉफ्टवेअर (NVCS) v1.7 किंवा v1.8.

ओलिंक कस्टम रेसिपी स्थापित करा
रन सीक्वेन्स करण्यासाठी ओलिंक कस्टम रेसिपी इन्स्टॉल करण्यासाठी सूचनांचे अनुसरण करा.

सिक्वेन्सिंग अभिकर्मक तयार करा
NaOH आणि Tris-HCl पातळ करा आणि अनुक्रमणासाठी Olink लायब्ररी तयार करा.

NaOH डायल्युशन तयार करा
दिलेल्या सूचनांनुसार ०.२ नॅनोएच डायल्युशन तयार करा आणि लायब्ररीजना विकृत करण्यासाठी १२ तासांच्या आत वापरा.

  1. अभिकर्मक: मिलीक्यू पाणी
  2. खंड: 80 एल
  3. अभिकर्मक: १ एन NaOH स्टॉक
  4. खंड: 20 एल

NaOH डायल्युशन पूर्णपणे फिरवा आणि वापरण्यापूर्वी ते खाली फिरवा.

भाग २: ओव्हरview

परिचय

अभिप्रेत वापर

  • ऑलिंक® एक्सप्लोर हे मानवी प्रोटीन बायोमार्कर शोधासाठी एक मल्टीप्लेक्स इम्युनोसे प्लॅटफॉर्म आहे. उत्पादन केवळ संशोधनाच्या वापरासाठी आहे, आणि निदान प्रक्रियेत वापरण्यासाठी नाही. प्रयोगशाळेचे काम केवळ प्रशिक्षित प्रयोगशाळेतील कर्मचाऱ्यांद्वारेच चालवले जाईल. डेटा प्रक्रिया केवळ प्रशिक्षित कर्मचार्‍यांकडूनच केली जाईल. परिणाम संशोधकांनी इतर नैदानिक ​​​​किंवा प्रयोगशाळेतील निष्कर्षांच्या संयोगाने वापरायचे आहेत.

या मॅन्युअल बद्दल

  • हे मॅन्युअल Illumina® NovaSeq™ 6000 S4 वर Olink® Explore HT लायब्ररी अनुक्रमित करण्यासाठी आवश्यक असलेल्या सूचना प्रदान करते.
  • या मॅन्युअलमध्ये वर्णन केलेल्या सूचनांचे काटेकोरपणे आणि स्पष्टपणे पालन केले पाहिजे. प्रयोगशाळेच्या टप्प्यांमध्ये कोणतेही विचलन झाल्यास डेटा खराब होऊ शकतो.
    प्रयोगशाळेतील कार्यप्रवाह सुरू करण्यापूर्वी, Olink® Explore Over चा सल्ला घ्या.view प्लॅटफॉर्मच्या परिचयासाठी वापरकर्ता पुस्तिका, ज्यामध्ये अभिकर्मक, उपकरणे आणि आवश्यक कागदपत्रांची माहिती समाविष्ट आहे, एक ओव्हरview कार्यप्रणाली, तसेच प्रयोगशाळेच्या मार्गदर्शक तत्त्वांचे.
  • Olink® Explore HT Reagent Kits कसे चालवायचे याबद्दलच्या सूचनांसाठी, Olink® Explore HT वापरकर्ता पुस्तिका पहा.
  • ओलिंक® एक्सप्लोर सीक्वेन्स निकालांच्या डेटा प्रोसेसिंग आणि विश्लेषणासाठी, ओलिंक® एनपीएक्स एक्सप्लोर एचटी वापरकर्ता पुस्तिका पहा.
  • या साहित्यात असलेले सर्व ट्रेडमार्क आणि कॉपीराइट हे ओलिंक प्रोटिओमिक्स एबीची मालमत्ता आहेत, अन्यथा सांगितले नसल्यास.

अलर्ट पातळीची व्याख्या

  • ओलिंक एक्सप्लोर मॅन्युअलमध्ये खालील अलर्ट लेव्हल्स वापरले आहेत:

ओलिंक-नोव्हासेक-६०००-एस४-एक्सप्लोर-एचटी-सिक्वेन्सिंग-सिस्टम-आकृती- (१)इशारा: संभाव्य धोकादायक परिस्थिती दर्शवते जी टाळली नाही तर दुखापत होऊ शकते.
ओलिंक-नोव्हासेक-६०००-एस४-एक्सप्लोर-एचटी-सिक्वेन्सिंग-सिस्टम-आकृती- (१)महत्त्वाचे: योग्यरित्या न केल्यास परिणामांवर परिणाम होऊ शकणारी महत्त्वाची कृती दर्शवते.
ओलिंक-नोव्हासेक-६०००-एस४-एक्सप्लोर-एचटी-सिक्वेन्सिंग-सिस्टम-आकृती- (१)टीप: अशी माहिती आहे जी विशिष्ट कार्य समजणे किंवा करणे सोपे करू शकते.
ओलिंक-नोव्हासेक-६०००-एस४-एक्सप्लोर-एचटी-सिक्वेन्सिंग-सिस्टम-आकृती- (१)सुरक्षित थांबण्याचा मुद्दा: प्रोटोकॉल सुरक्षितपणे थांबवता येईल आणि नंतर पुन्हा सुरू करता येईल अशी पायरी दर्शवते.
ओलिंक-नोव्हासेक-६०००-एस४-एक्सप्लोर-एचटी-सिक्वेन्सिंग-सिस्टम-आकृती- (१)वेळेची संवेदनशील पायरी: मर्यादित कालावधीत पूर्ण करणे आवश्यक असलेले पाऊल दर्शवते. योग्यरित्या पूर्ण न केल्यास परिणाम खराब होऊ शकतात.

संबद्ध दस्तऐवजीकरण

  • ओलिंक® एक्सप्लोर एचटी वापरकर्ता मॅन्युअल
  • Olink® NPX HT एक्सप्लोर वापरकर्ता मॅन्युअल

तांत्रिक समर्थन

  • तांत्रिक समर्थनासाठी, Olink Proteomics येथे संपर्क साधा support@olink.com.

भाग १:

प्रयोगशाळेच्या सूचना

परिचय

  • या प्रकरणात NovaSeq™ 6000 वर Olink Explore HT Reagent Kit वापरून NovaSeq™ 6000 S4 Reagent Kit v1.5 (35 सायकल) वापरून तयार केलेल्या Olink लायब्ररींचे अनुक्रम कसे करायचे याबद्दल सूचना दिल्या आहेत. अनुक्रमणासाठी वापरलेला प्रोटोकॉल हा Illumina® NovaSeq™ 6000 साठी Illumina® NovaSeq™ मानक वर्कफ्लोचे रूपांतर आहे.
    अनुक्रमांकन सुरू करण्यापूर्वी, शुद्ध केलेल्या ग्रंथालयांची गुणवत्ता पडताळली गेली आहे याची खात्री करा. गुणवत्ता नियंत्रणाविषयी सूचनांसाठी ओलिंक एक्सप्लोर एचटी वापरकर्ता पुस्तिका पहा.

क्रमवारीची योजना करा.

  • स्टँडर्ड वर्कफ्लो वापरून प्रत्येक NovaSeq™ 6000 S4 फ्लो सेलमध्ये एक Olink® लायब्ररी अनुक्रमित केली जाऊ शकते आणि प्रत्येक रनमध्ये दोन Olink® लायब्ररी अनुक्रमित केल्या जाऊ शकतात.
  • आठ वेगवेगळ्या ब्लॉक्सशी जुळणाऱ्या आठ शुद्ध केलेल्या लायब्ररींना समान व्हॉल्यूम रेशो (१:१) मध्ये एकत्र करून ओलिंक® लायब्ररी तयार केली जाते. ओलिंक एक्सप्लोर एचटी वापरकर्ता पुस्तिका पहा.

ओलिंक कस्टम रेसिपी स्थापित करा.

  • कस्टम रेसिपी फोल्डर अनझिप करा आणि ओलिंक कस्टम रेसिपी XML सेव्ह करा. file (Olink_NovaSeq6K_STND_S4) योग्य फोल्डरमध्ये (शक्यतो मानक रेसिपी फोल्डरमध्ये नाही).

टीप: Olink कस्टम रेसिपी फक्त NovaSeq™ 6000 S4 Reagent Kit v1.5 (35 सायकल) आणि NovaSeq Control Software (NVCS) v1.7 आणि v1.8 सह काम करेल. जर इन्स्ट्रुमेंटवर दुसरे NovaSeq कंट्रोल सॉफ्टवेअर स्थापित केले असेल, तर कृपया सपोर्टशी संपर्क साधा. support@olink.com.

सिक्वेन्सिंग अभिकर्मक तयार करा

खंडपीठ तयार करा

  • NovaSeq™ 6000 S4 अभिकर्मक किट v1.5 (35 सायकल)

सूचना

  1. गोठलेले S4 SBS आणि S4 क्लस्टर (CPE) कार्ट्रिज खोलीच्या तापमानाच्या पाण्यात अर्धवट बुडवून ठेवा आणि त्यांना 4 तास वितळू द्या. कार्ट्रिजचे सर्व अभिकर्मक जलाशय पूर्णपणे वितळले आहेत याची खात्री करा.
    टीप: सोयीसाठी, आदल्या दिवशी काडतुसे वितळवा आणि रात्रभर ४°C वर (२४ तासांपर्यंत) साठवा. वितळलेले अभिकर्मक काडतुसे एकदाच गोठवता येतात.
  2. काडतूसाचे तळ कागदी टॉवेलने पूर्णपणे वाळवा आणि गरज पडल्यास फॉइल सील लिंट-फ्री टिश्यूने वाळवा. जर काडतूस ४ तासांच्या आत वापरायचे असतील तर खोलीच्या तपमानावर ठेवा.
    टीप: जर अभिकर्मक ४ तासांच्या आत वापरले गेले नाहीत, तर ते +४°C तापमानात २४ तासांपर्यंत साठवले जाऊ शकतात.

क्रमवारीसाठी Olink® लायब्ररी तयार करा

  • या टप्प्यादरम्यान, NaOH आणि Tris-HCl डायल्युशन तयार केले जातात आणि शुद्ध आणि गुणवत्ता-नियंत्रित ओलिंक लायब्ररी क्रमिक चरणांमध्ये डायल्युट आणि डिनेचर केली जाते.

NaOH dilution तयार करा
ग्रंथालयांना विकृत करण्यासाठी नंतर NaOH डायल्युशनचा वापर केला जातो.

खंडपीठ तयार करा

  • 1 एन NaOH स्टॉक
  • मिलीक्यू पाणी
  • 1x मायक्रोसेन्ट्रीफ्यूज ट्यूब (1.5 मिली)
  • मॅन्युअल पिपेट (10-100 μL)
  • पिपेट टिपा फिल्टर करा

आपण सुरू करण्यापूर्वी
मायक्रोसेंट्रीफ्यूज ट्यूबवर “0.2 N NaOH” असे चिन्हांकित करा.

सूचना

  1. ०.२ एन NaOH ट्यूबमध्ये ०.२ एन NaOH डायल्युशन तयार करा:
    अभिकर्मक व्हॉल्यूम (μL)
    मिलीक्यू पाणी 80
    1 एन NaOH स्टॉक 20
  2. 0.2 N NaOH ट्यूब पूर्णपणे भोवरा आणि खाली फिरवा. 12 तासांच्या आत वापरा.

Tris-HCl dilution तयार करा
विकृत ग्रंथालयांना निष्क्रिय करण्यासाठी नंतर ट्रायस-एचसीएल डायल्युशनचा वापर केला जातो. बेंच तयार करा

  • 1 M Tris-HCl pH 8.0 स्टॉक (Trizma® हायड्रोक्लोराइड द्रावण)
  • मिलीक्यू पाणी
  • 1x मायक्रोसेन्ट्रीफ्यूज ट्यूब (1.5 मिली)
  • मॅन्युअल पिपेट (10-100 μL)
  • पिपेट टिपा फिल्टर करा

आपण सुरू करण्यापूर्वी

  • मायक्रोसेंट्रीफ्यूज ट्यूब "ट्रिस-एचसीएल" चिन्हांकित करा.

सूचना

  1. ट्रायस-एचसीएल ट्यूबमध्ये ४०० मिमी ट्रायस-एचसीएल डायल्युशन तयार करा:
    अभिकर्मक व्हॉल्यूम (μL)
    मिलीक्यू पाणी 60
    1 M Tris-HCl pH 8.0 स्टॉक (Trizma® हायड्रोक्लोराइड द्रावण) 40
  2. ट्रायस-एचसीएल ट्यूब पूर्णपणे फिरवा आणि खाली फिरवा.

ओलिंक® लायब्ररी पातळ करा
या टप्प्यादरम्यान, शुद्ध आणि गुणवत्ता-नियंत्रित ग्रंथालये 1:150 या प्रमाणात पातळ केली जातात.

खंडपीठ तयार करा

  • ओलिंक एक्सप्लोर एचटी वापरकर्ता मॅन्युअलनुसार तयार केलेले पीएल ट्यूब.
  • मिलीक्यू पाणी
  • 1x मायक्रोसेन्ट्रीफ्यूज ट्यूब (1.5 मिली)
  • मॅन्युअल पिपेट्स (०.५-१० μL, १००-१००० μL)
  • पिपेट टिपा फिल्टर करा

आपण सुरू करण्यापूर्वी

  • जर पीएल ट्यूब गोठली असेल तर ती वितळवा.
  • नवीन मायक्रोसेंट्रीफ्यूज ट्यूबला "दिल" असे चिन्हांकित करा.

सूचना

  1. डिल ट्यूबमध्ये ७४५ μL मिलीक्यू पाणी घाला.
  2. पीएल ट्यूबला व्होर्टेक्स करा आणि थोडा वेळ खाली फिरवा.
  3. पीएल ट्यूबमधून डिल ट्यूबमध्ये ५ μL स्थानांतरित करा.
  4. डिल ट्यूबला व्होर्टेक्स करा आणि थोडा वेळ खाली फिरवा.
    टीप: संभाव्य पुनर्वापराच्या बाबतीत लिब ट्यूब (ट्युब्स) -२० डिग्री सेल्सिअस तापमानावर साठवा.

डेनेचर ओलिंक® लायब्ररी
या टप्प्यादरम्यान, सौम्य केलेल्या ग्रंथालयांचे विकृतीकरण केले जाते.

खंडपीठ तयार करा

  • मागील चरणात तयार केलेला दिल ट्यूब
  • ०.२ एन NaOH ट्यूब, मागील चरणात नव्याने तयार केलेली
  • मागील चरणात तयार केलेली ट्रायस-एचसीएल ट्यूब
  • 1x मायक्रोसेन्ट्रीफ्यूज ट्यूब (1.5 मिली)
  • मॅन्युअल पिपेट्स (०.५-१० μL, १००-१००० μL)
  • पिपेट टिपा फिल्टर करा

आपण सुरू करण्यापूर्वी

  • नवीन मायक्रोसेंट्रीफ्यूज ट्यूबला "डेन" म्हणून चिन्हांकित करा.

सूचना

  1. डिल ट्यूबमधून डेन ट्यूबमध्ये ३१० μL हलवा, नंतर डेन ट्यूबमध्ये ७७ μL ०.२ N NaOH घाला.
  2. डेन ट्यूबला व्होर्टेक्स करा आणि थोडा वेळ खाली फिरवा.
  3. दिल ट्यूब टाकून द्या.
  4. लायब्ररीला डिनेचर करण्यासाठी खोलीच्या तपमानावर डेन ट्यूब 8 मिनिटे उबवा.
  5. अभिक्रिया निष्प्रभ करण्यासाठी ट्रायस-एचसीएल ट्यूबमधून ७८ μL डेन ट्यूबमध्ये स्थानांतरित करा.
  6. डेन ट्यूबला वळवा आणि थोडा वेळ खाली फिरवा. पुढे जाण्यासाठी तयार होईपर्यंत +४°C वर साठवा.

NovaSeq™ 6000 मध्ये अभिकर्मक लोड करा

या टप्प्यादरम्यान, फ्लो सेल, SBS, क्लस्टर आणि बफर कार्ट्रिज NovaSeq™ 6000 मध्ये लोड केले जातात. विकृत लायब्ररी लायब्ररी ट्यूबमध्ये लोड केली जाते आणि S4 क्लस्टर (CPE) कार्ट्रिजमध्ये घातली जाते.

खंडपीठ तयार करा

  • १x S4 फ्लो सेल
  • नोव्हासेक™ ६००० एस४ अभिकर्मक किट(चे) v१.५ (३५ चक्र), मागील चरणात तयार केलेले, लायब्ररी ट्यूबसह
  • लिंट-मुक्त आयसोप्रोपाइल वाइप्स
  • कमी-लिंट लॅब टिश्यू

आपण सुरू करण्यापूर्वी

  • रेफ्रिजरेटेड फ्लो सेल फॉइल पॅकेज खोलीच्या तपमानावर १०-१५ मिनिटे येऊ द्या. सील काढू नका.
  • S4 SBS आणि S4 क्लस्टर (CPE) काडतुसे पूर्णपणे वितळलेली आणि पूर्णपणे वाळलेली असल्याची खात्री करा.
  • NovaSeq™ 6000 इन्स्ट्रुमेंटमधून कोणतेही आयटम काढून टाका.

NovaSeq™ 6000 मध्ये फ्लो सेल लोड करा

  1. NovaSeq™ 6000 होम स्क्रीनवर, Sequence निवडा.
  2. लागू असलेला प्रोटोकॉल निवडा: बाजूला A (A) किंवा बाजूला B (B) वर चालणारा सिंगल फ्लो सेल.
  3. लोड रन सेटअप स्क्रीनवर, फ्लो सेल दरवाजा उघडण्यासाठी ओके निवडा.
  4. क्लोज फ्लो सेल डोअर निवडा. सेन्सर्स आणि आरएफआयडी तपासले जातात आणि फ्लो सेल आरएफआयडी स्क्रीनवर प्रदर्शित होतात.
    टीप: जर फ्लो सेल RFID स्क्रीनवर दिसत नसेल, तर फ्लो सेल बारकोड आणि फ्लो सेल कंपार्टमेंट लिंट-फ्री आयसोप्रोपाइल वाइपने पुसून टाका आणि नंतर फ्लो सेल रीलोड करा.

NovaSeq™ 6000 मध्ये SBS आणि क्लस्टर कार्ट्रिज लोड करा.

  1. अभिकर्मक मिसळण्यासाठी S4 SBS आणि S4 क्लस्टर (CPE) काडतुसे दहा वेळा उलटा करा, नंतर हवेचे बुडबुडे कमी करण्यासाठी काडतुसांच्या तळाशी बेंचवर हळूवारपणे दाबा.
  2. NovaSeq™ 6000 चे लिक्विड कंपार्टमेंट आणि अभिकर्मक चिलर दरवाजे उघडा.
  3. वापरलेले एसबीएस आणि क्लस्टर काडतुसे काढून टाका.
  4. NovaSeq™ 6000 S4 अभिकर्मक किटसह प्रदान केलेल्या लायब्ररी ट्यूबचे कॅप काढा.
  5. डेन ट्यूबमधील सर्व विकृत ओलिंक लायब्ररी (~४६५ μL) लायब्ररी ट्यूबच्या तळाशी लोड करा.
  6. हवेचे बुडबुडे कमी करण्यासाठी लायब्ररी ट्यूब बेंचवर हळूवारपणे दाबा.
  7. नवीन S4 क्लस्टर (CPE) कार्ट्रिजच्या लायब्ररी ट्यूब पोझिशन (#8) मध्ये लायब्ररी ट्यूब घाला.ओलिंक-नोव्हासेक-६०००-एस४-एक्सप्लोर-एचटी-सिक्वेन्सिंग-सिस्टम-आकृती- (१)
  8. तयार केलेले काडतुसे अभिकर्मक चिलर ड्रॉवरमध्ये लोड करा आणि "इन्सर्ट" लेबल्स इन्स्ट्रुमेंटच्या मागील बाजूस तोंड करून ठेवा:
    अ. S4 SBS कार्ट्रिज (राखाडी लेबल) डावीकडे ठेवा.
    b. लायब्ररी ट्यूब असलेले S4 क्लस्टर (CPE) कार्ट्रिज (केशरी लेबल) उजवीकडे ठेवा.
  9. द्रव कंपार्टमेंट आणि अभिकर्मक चिलरचे दरवाजे बंद करा.

NovaSeq™ 6000 मध्ये बफर कार्ट्रिज लोड करा.

  1. बफर ड्रॉवर उघडा.
  2. वापरलेले बफर कार्ट्रिज बफर ड्रॉवरमधून काढा. वापरलेल्या बफर कार्ट्रिजमध्ये फॉइल सील छिद्रित आहेत.
  3. बफर ड्रॉवरमध्ये एक नवीन बफर कार्ट्रिज ठेवा ज्यावर ड्रॉवरच्या समोर “इल्युमिना” लेबल असेल. ड्रॉवरच्या फरशीवर आणि बाजूंना उंचावलेल्या मार्गदर्शकांसह कार्ट्रिज संरेखित करा. बफर कार्ट्रिज समान रीतीने बसलेला आहे आणि ड्रॉवर बंद करता येतो याची खात्री करा.
  4. अभिकर्मक बाटल्या रिकामी करा:
    अ. सांडपाण्यापासून रोखण्यासाठी लहान अभिकर्मक बाटली सील करा. बाटली अल्कोव्हमधून काढा आणि लागू असलेल्या मानकांनुसार त्यातील सामग्री टाकून द्या.
    चेतावणी: वापरलेल्या छोट्या अभिकर्मक बाटलीमध्ये फॉर्मामाइड असते. बाटली अल्कोव्हमधून काढताना, बाटली सांडू नये म्हणून बाटलीला जोडलेल्या टोपीने सील करा.
    b. छोटी बाटली (कॉपर न लावता) अल्कोव्हमध्ये परत करा.
    क. मोठ्या अभिकर्मक बाटलीला जोडलेल्या टोपीने सील करा जेणेकरून ते सांडणार नाही. बाटली अल्कोव्हमधून काढा आणि लागू असलेल्या मानकांनुसार त्यातील सामग्री टाकून द्या.
    ड. मोठी बाटली (कॉपर न लावता) अल्कोव्हमध्ये परत करा.
    चेतावणी: वापरलेल्या अभिकर्मक बाटल्या रिकामी न केल्यास त्या बंद होऊ शकतात आणि ओव्हरफ्लो होऊ शकतात, ज्यामुळे उपकरणाचे नुकसान होऊ शकते आणि सुरक्षिततेला धोका निर्माण होऊ शकतो.
  5. दोन्ही अभिकर्मक बाटल्या रिकाम्या आहेत हे मान्य करून चेकबॉक्स तपासा.

Olink® सिक्वेन्सिंग रन करा.

या पायरी दरम्यान, ऑलिंक कस्टम रेसिपी वापरून अनुक्रमण सुरू केले जाते.

रन पॅरामीटर्स सेट करा आणि सिक्वेन्सिंग रन सुरू करा.

  1. रन सेटअप निवडा.
  2. NovaSeq™ स्टँडर्ड वर्कफ्लो निवडला आहे याची खात्री करा (लायब्ररी ट्यूबमध्ये पातळ आणि विकृत लायब्ररी लोड केलेली आणि भरलेली आहे याची खात्री करा).
  3. रन नेम फील्डमध्ये, एक अद्वितीय प्रयोग आयडी प्रविष्ट करा.
  4. सायकल नंबर फील्ड्स संपादित करू नका; डीफॉल्ट व्हॅल्यू म्हणून सोडा.
  5. सध्याच्या रनसाठी सेटिंग्ज लागू करण्यासाठी प्रगत पर्याय विस्तृत करा. आउटपुट फोल्डर अंतर्गत, कच्च्या डेटाच्या सध्याच्या रनसाठी आउटपुट फोल्डर बदलण्यासाठी ब्राउझ निवडा.
  6. कस्टम रेसिपी निवडा, नंतर कस्टम रेसिपी XML वापरण्यासाठी ब्राउझ करा. file धावण्यासाठी: Olink_NovaSeq6K_STND_S4.
  7. पुन्हा निवडाview. सॉफ्टवेअर पुष्टी करते की निर्दिष्ट पॅरामीटर्स रेसिपीसाठी योग्य आहेत.view स्क्रीनवर रेसिपीमध्ये परिभाषित केल्याप्रमाणे अपडेट केलेले सायकल क्रमांक (२४, ०, ०, ०) दिसतील.
  8. Re वर प्रदर्शित रन पॅरामीटर्सची पुष्टी कराview स्क्रीन कोणतेही पॅरामीटर्स संपादित करण्यासाठी, रन सेटअप स्क्रीनवर परत येण्यासाठी मागे दाबा.
  9. "स्टार्ट, रन" निवडा. ऑटोमॅटिक प्री-रन चेक पूर्ण झाल्यानंतर (~५ मिनिटे) रन सुरू होईल याची खात्री करा. सीक्वेन्सिंग रन टाइम अंदाजे ९ तास ३० मिनिटे आहे.
    टीप: कोणत्याही पूर्व-चालू तपासणी अपयशांसाठी, उत्पादकाच्या सूचना पहा.
    टीप: सिक्वेन्सिंग रन दरम्यान NovaSeq™ 6000 ला टक्कर देऊ नका किंवा इतर कोणत्याही प्रकारे अडथळा आणू नका याची काळजी घ्या. हे उपकरण कंपनांना संवेदनशील आहे.
  10. कामाची जागा स्वच्छ करा. गरज पडल्यास, फ्लो सेल डॉक लिंट-फ्री आयसोप्रोपाइल वाइपने स्वच्छ करा आणि स्टोरेजमध्ये परत येण्यापूर्वी कमी-लिंट लॅब टिश्यूने वाळवा.
  11. जेव्हा सिक्वेन्सिंग पूर्ण होते, तेव्हा सॉफ्टवेअर स्वयंचलित पोस्ट-रन वॉश सुरू करते ज्याला सुमारे 80 मिनिटे लागतात. वॉश पूर्ण झाल्यावर, सिस्टम सुरक्षित स्थितीत ठेवली जाते आणि होम बटण सक्रिय होते. पुढील रन होईपर्यंत सर्व उपभोग्य वस्तू जागीच ठेवा.

धावण्याच्या प्रगतीचे निरीक्षण करा

  • दिलेल्या प्रथिनांच्या एकाग्रतेचा अंदाज घेण्यासाठी ज्ञात क्रमाचे प्रमाण मोजण्यासाठी ओलिंक NGS चा वापर रीडआउट म्हणून करते.amples (इतर s च्या सापेक्षampलेस). प्रत्येक एक्सप्लोर सिक्वेन्सिंग रनमधील डेटा गुणवत्ता मुख्यतः Olink तंत्रज्ञानासाठी अद्वितीय QC पॅरामीटर्सद्वारे निर्धारित केली जाते. म्हणून, पारंपरिक NGS मध्ये वापरलेले मानक गुणवत्ता नियंत्रण मेट्रिक्स, जसे की Q-स्कोअर, कमी गंभीर आहेत.

पुनरावृत्ती इतिहास

आवृत्ती तारीख वर्णन
1.1 ५७४-५३७-८९०० 6 आणि 10.1: Olink_NovaSeq6K_STND_S4 पुनर्नामित केले. संपादकीय बदल
1.0 ५७४-५३७-८९०० नवीन
  • www.olink.com
  • © २०२३ ओलिंक प्रोटिओमिक्स एबी.
  • ओलिंक उत्पादने आणि सेवा केवळ संशोधन वापरासाठी आहेत आणि निदान प्रक्रियेत वापरण्यासाठी नाहीत.
  • या दस्तऐवजातील सर्व माहिती सूचना न देता बदलू शकते. या दस्तऐवजाचा उद्देश कोणत्याही प्रकारच्या हमी, प्रतिनिधित्व,/किंवा शिफारसी देणे नाही, जोपर्यंत अशा हमी, प्रतिनिधित्व,/किंवा शिफारसी स्पष्टपणे नमूद केल्या जात नाहीत.
  • या दस्तऐवजाच्या आधारे संभाव्य वाचकाच्या कृतींमुळे उद्भवणारी कोणतीही जबाबदारी ओलिंक गृहीत धरत नाही.
  • OLINK, NPX, PEA, PROXIMITY EXTENSION, INSIGHT आणि Olink लोगोटाइप हे Olink Proteomics AB द्वारे नोंदणीकृत किंवा प्रलंबित नोंदणी ट्रेडमार्क आहेत. सर्व तृतीय-पक्ष ट्रेडमार्क त्यांच्या संबंधित मालकांची मालमत्ता आहेत.
  • ओलिंक उत्पादने आणि परख पद्धती अनेक पेटंट आणि पेटंट अर्जांमध्ये समाविष्ट आहेत. https://www.olink.com/patents/
  • 1351, v1.1, 2023-12-12

वारंवार विचारले जाणारे प्रश्न

प्रश्न: मी तांत्रिक समर्थनाशी संपर्क कसा साधू?

अ: तांत्रिक समर्थनासाठी, support@olink.com वर ओलिंक प्रोटिओमिक्सशी संपर्क साधा.

कागदपत्रे / संसाधने

ओलिंक नोव्हासेक ६००० एस४ एक्सप्लोर एचटी सिक्वेन्सिंग सिस्टम [pdf] वापरकर्ता मॅन्युअल
नोव्हासेक ६००० एस४, नोव्हासेक ६००० एस४ एचटी सिक्वेन्सिंग सिस्टम एक्सप्लोर करा, एचटी सिक्वेन्सिंग सिस्टम एक्सप्लोर करा, एचटी सिक्वेन्सिंग सिस्टम, सिक्वेन्सिंग सिस्टम

संदर्भ

एक टिप्पणी द्या

तुमचा ईमेल पत्ता प्रकाशित केला जाणार नाही. आवश्यक फील्ड चिन्हांकित आहेत *